Упражнения в MarvinSketch

Упражнение 1.

2'-дезоксигуанозиндифосфат, 2'-дезокситимидинмонофосфат псевдоуридин, уридин

Упраженение 2.

DNA

Упраженение 3.

В этом задании я сопоставляла структуру водородных связей в канонических и теоретически возможных неканоничеких парах оснований (одно из которых цитозин). Вот какие варианты образования водородных связей у меня получились.

1. Каноническая пара (C-G)

C-G

2. Пара (C-A)

C-A

3. Пара (C-T)
В этом случае у меня получилось два варианта образования водородных связей. В первом случае с участием атома кислорода, связанного с С2, а во втором - с С4.
Для урацила способы образования водородных связей будут такими же.

C-T(1) C-T(2)

4. Пара (C-С)

C-G

Из всех получившихся пар, пара С-A мне кажется наименее правдоподобной, т.к. между этими азотистыми основаниями возникает только 1 водородная связь. Пары С-С и С-T должны быть более устойчивыми, поскольку там образуются по 2 водородные связи. Но возможно наличие в этих парах атомов азота(пара С-С) или кислорода(пара С-T) напротив друг друга будет уменьшать устойчивость водородных связей, и эти пары будут менее стабильными, чем канонические с 2 водородными связями.