Задание:По данному аннотированному файлу в формате gb (из GenBank или RefSeq) или embl (из ENA) создать файл с кодирующими последовательностями в формате fasta, добавив в описание каждой последовательности функцию белка (из поля product).
команда запуска: bash scriptic.sh seqfile outfile.fasta
seqfile - имя данного аннотированного файла
outfile - выходной файл (имя задаёт пользователь)
если запустить скрипт без параметров, то он сам спросит имя входной последовательности и выходного файла.
"Скрипт" написан на bash с использованием команды EMBOSS extractfeat
Результат тестового запуска:
Входной файл -plasmid.txt
Команда: bash scriptic.sh plasmid.txt finaltestik.fasta
Выходной файл: finaltestik.fasta