На страницу второго семестра
Матрицы замен
Изучение матрицы BLOSUM62
Средний вес замен между аминокислотами.
Внутри группы FYW
2
Внутри группы KRH
0,3333
Между группами FYW и KRH
-1,8889
Вычисление весов замен аминокислот на основе блока
Средний вес замен аминокислот:
Веса аминокислотных замен рассчитаны для Ala, Asp и Arg.
A-A
2
A-R
-2
A-N
-1
Аналогичные данные из матрицы blosum62:
A-A
4
A-R
-1
A-N
-2
Если сравнивать эти значения, то видно, что различие есть, но в целом знаки не отличаются.