Получено дерево:
+------F
+100.0-|
+100.0-| +------E
| |
+------| +-------------D
| |
| | +------A
| +-------100.0-|
| +------B
|
+---------------------------C
СFEDBA
.***.. 100.00
....** 100.00
.**... 100.00
Результаты практически совпадают с результатами бутстреп-анализа. Топология дерева, таким образом, остается неизменной.
Для получения переукорененного дерева была использована команда:
fretree 6 mutant.treefile
Сначала следует ввести параметр М для укоренения дерева посередине.
Затем программа спрашивает записать ли дерево в файл, следует ответить У
И, наконец, на вопрос программы об укоренении дерева следует ответить буквой R.
Результатом является файл со скобочной формулой.
Само же дерево имеет вид:
,----------------------------------------------------------2:C
,--------------8
! ! ,--------------------------3:D
! `-------------------------9
! ! ,---------------4:E
-11 `------10
! `---------------5:F
!
! ,---------------------------------------------------6:A
`--------------------7
`----------------------------------------------------1:B
Для получение филограммы в команде был использован параметр р. Таким образом, команды выглядела так: fdrawgram mu.treefile -style p На выходе было получено дерево, сохранено в файле с расширением ps, а затем переведено в gif. Выглядит оно так:
©Babskaya Evgeniya, 2005