HIV1-интеграза катализирует присоединение к 3'-концу нуклеотидов по одному на основе РНК-матрицы(может также использовать ДНК-матрицу). Данный ермент не может инициировать синтез новой цепи, требует для работы наличия РНК- или ДНК-праймера.
Активный центр фермента содержит 2 остатка аспартата(с номерами 64 и 116). Между азотом ASP-116 и кислородом бокового радикала ASP-64 обнаружена водородная связь.
Активный центр окружают ASN-120, GLY-118, ASN-117, LEU-63, THR-115, HIS-114, GLN-62, LEU-74, CAF-65(модифицированный цистеин), VAL-75, THR-66, ILE-73, ASN-155. ASP-64 связывается водородными связями с THR-115 и GLN-62. ASP-116 связывается водородной связью с THR-115.
Ингибитор WBV не взаимодействует с активным центром и связан водородной связью с GLN-95. Данный ингибитор, исходя из выложенных данных, мешает связыванию мономеров HIV1-интегразы, что не дает ей выполнять каталитические функции.
