Описание белка бактерии Corynebacterium deserti GIMN1.010

Выбор белка

Зайдя на сайте UniProt в расширенный поиск, сначала я выбрала базу для поиска – UniProtKB, затем фильтр, с помощью которого будет осуществляться поиск – Taxonomy[OC]. Ввела название бактерии – Corynebacterium deserti GIMN1.010.

запрос
Рис 1. Выбор базы и фильтра

В итоге поиск осуществлялся по запросу (taxonomy_id:931089), и по нему нашлось 2 714 результатов.

результаты
Рис 1. Результаты поиска

Я решила выбрать белок dITP/XTP pyrophosphatase, так как он хорошо аннториван. Его ID – A0A0M3QA38_9CORY, AC – A0A0M3QA38.

Информация о белке

дИТФ/КТФ-пирофосфатаза проявляет нуклеозидтрифосфатазную активность по отношению к дезоксиинозинтрифосфату (дИТФ) и ксантозинтрифосфату (КТФ), мутагенным продуктам дезаминирования пуриновых нуклеотидов, и, следовательно, может снижать количество нуклеотидов, которые могут неправильно включаться во время репликации ДНК.

Поисковые запросы
  1. (protein_name:"dITP/XTP pyrophosphatase") AND (cc_catalytic_activity:XTP) NOT (taxonomy_id:931089): 40 343 результата (белки других организмов, название которых включает название выбранного белка, и с той же каталитической активностью)
  2. NOT (protein_name:"dITP/XTP pyrophosphatase") AND (cc_catalytic_activity:XTP) AND (cc_catalytic_activity:ITP) AND (cc_catalytic_activity:dITP): 2 722 результата (другие белки с той же каталитической активностью)
  3. (protein_name:"dITP/XTP pyrophosphatase") AND (taxonomy_id:2759): 3 результата (встречаемость выбранного белка у эукариот, все три записи относятся к Nymphon striatum)
  4. NOT (protein_name:"dITP/XTP pyrophosphatase") AND (length:[205 TO 205]) AND (mass:[21846 TO 21846]): 158 результатов (другие белки с той же длинной и массой)