Филогенетическое дерево


Отобранные бактерии
Таблица 1. Бактерии и их мнемоника
Название Мнемоника Таксономия (NCBI Taxonomy)
Agrobacterium fabrum AGRFC cellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Alphaproteobacteria; Hyphomicrobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Agrobacterium; Agrobacterium tumefaciens complex
Brucella suis BRUSU cellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Alphaproteobacteria; Hyphomicrobiales; Brucellaceae; Brucella/Ochrobactrum group; Brucella
Escherichia coli ECOLI cellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Neisseria meningitidis NEIMA cellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Neisseria
Pseudomonas mendocina PSEMY cellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas; Pseudomonas aeruginosa group
Rhizobium meliloti RHIME cellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Alphaproteobacteria; Hyphomicrobiales; Rhizobiaceae; Sinorhizobium/Ensifer group; Sinorhizobium
Thiobacillus denitrificans THIDA cellular organisms; Bacteria; Pseudomonadota; Betaproteobacteria; Nitrosomonadales; Thiobacillaceae; Thiobacillus
Скобочная формула дерева

(((AGRFC, RHIME), BRUSU),((THIDA, NEIMA), (PSEMY, ECOLI)));

Изображение дерева
tree
Рис 1. Изображение дерева
Ветви дерева

Дерево содержит 4 нетривиальные ветви:

(AGRFC, RHIME) против (BRUSU, NEIMA, THIDA, PSEMY, ECOLI) – отделяет кладу Rhizobiaceae

(AGRFC, RHIME, BRUSU) против (NEIMA, THIDA, PSEMY, ECOLI) – отделяет кладу Alphaproteobacteria

(AGRFC, RHIME, BRUSU, NEIMA, THIDA) против (PSEMY, ECOLI) – отделяет кладу Gammaproteobacteria

(AGRFC, RHIME, BRUSU, PSEMY, ECOLI) против (NEIMA, THIDA) – отделяет кладу Betaproteobacteria