Краткое описание бета-глюкозидазы

β-глюкозидаза (beta-glucosidase) - фермент, катализирующий гидролиз терминальных невосстанавливающих β-D-глюкозидных остатков с высвобождением β-D-глюкозы.[1] Краткая информация о белке, полученная из записи NC_011978 базы NCBI с полным геномом бактерии Thermotoga neapolitana, представлена в таблице 1.

Таблица 1. Информация о β-глюкозидазе из Thermotoga neapolitana (идентификатор белка в базе данных RefSeq YP_002534212.1).

Вид информации	Квалификатор в записи генома	Значение
Локус гена в геноме	/locus_tag	CTN_0670
Имя гена	/gene	не указано
Идентификатор гена в базе Gene	/db_xref="GeneID ...	7378122
Начало гена в геноме		673293
Конец гена в геноме		675464
На какой цепи кодируется ген		прямая
Длина гена (в парах нуклеотидов)		2172
Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein	/protein_id	YP_002534212.1
Длина белка (в аминокислотных остатках)		723

На сайте NCBI с помощью геномного браузера было получено изображение гена белка и его окресности (рисунок 1). Вероятно, данный ген входит в оперон. Такое предположение можно сделать потому, что ген расположен очень близко к соседним генам или перекрывается. Такая картина характерна для оперонов. Подробная информация о расположении генов в окружении гена YP_002534212.1 приведена в таблице 2.

Рисунок 1. Ген YP_002534212.1 и его окружение.

Таблица 2. Характеристика окружения гена YP_002534212.1.

Идентификатор гена	Расстояние до исследуемого гена (bp)	Направление цепи	Рамка считывания, относительно исследуемого гена
YP_002534210.1	178	Прямое	+3
YP_002534211.1	Перекрытие на 23	Прямое	+3
YP_002534213.1	Перекрытие на 26	Прямое	+2
YP_002534214.1	2016	Прямое	+1
YP_002534215.1	4004	Обратное	-2

Источники:
[1]. http://enzyme.expasy.org/EC/3.2.1.21