Геномные браузеры

Задание 1. UCSC.

Для выполнения данного задания был взят белок LAR4B_HUMAN:

• короткое имя гена: LARP4B полное имя гена (одно из множества альтернативных имен): La-related protein 4B
• закодирован на комплементарной цепи;
• находится в 10 хромосоме;
• принадлежит к короткому плечу хромосомы, к полосе 15.3
• координаты гена: 852,854-977
• количество альтернативных продуктов, закодированных в гене: 10

Название транскрипта	Количество экзонов	Длина белка(aa)
LARP4B-002	17	738
LARP4B-007	6	339
LARP4B-003	6	131
LARP4B-008	3	190
LARP4B-004	5	57
LARP4B-005	6	79


И еще 4 некодирующих транскрипта

Задание 2. Ensembl.

При помощи Ensembl было получено выравнивание для выбранного гена с гомологичным геном шимпанзе. При помощи программы distmat пакета EMBOSS было определено количество различий в выравнивании. Программа выдает количество замен на 100 оснований. Для данного выравнивания это 1.08. Количество полиморфизмов для данного гена 10319 (определено с помощью Ensembl).