Поиск мотивов в последовательности TPIS_ECOLI с помощью средств PROSITE.
В базе данных PROSITE собрана коллекция сайтов, мотивов и доменов. Они описаны с помощью паттернов.
С помощью программы ScanProsite (Scan a protein for PROSITE matches) были найдено 17 известных мотивов в последовательности TPIS_ECOLI
паттерн
[AV]-Y-E-P-[LIVM]-W-[SA]-I-G-T-[GK]
мотив в моем белке
165 - 175 AYEPVWAIGTG
Придуманная последовательность, максимально, на мой взгляд, удовлетворяющая паттерну:
VYEPLWSIGTK