Carbonic anhydrase 13

3D модель белка

Скрипт

Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичных структурах
#	Имена атомов	Длина связи (Å)	Угол N-O-C (°)
Альфа-спирали
1	N(225LEU) - O(221SER)	2.82	164.6
2	N(226ALA) - O(222SER)	2.93	153.5
3	N(227LYS) - O(223GLN)	3.52	140.7
4	N(227LYS) - O(224GLN)	3.06	116.6
5	N(228PHE) - O(225LEU)	3.00	126.5
6	N(229ARG) - O(225LEU)	3.69	153.1
Бета-тяжи
1	N(091ARG) - O(125TRP)	2.83	140.8
2	N(125TRP) - O(091ARG)	2.94	137.7
3	N(093ARG) - O(123VAL)	2.89	158.2
4	N(094GLN) - O(123VAL)	3.41	137.0
5	N(123VAL) - O(094GLN)	2.84	171.9
6	N(096HIS) - O(121HIS)	3.02	155.0
7	N(121HIS) - O(096HIS)	2.97	149.0
8	N(098HIS) - O(119GLU)	2.92	147.0
9	N(119GLU) - O(098HIS)	2.81	153.8

Среднее значение угла N-O-C в Альфа-спиралях составляет 142.5°, а длина связи 3.17Å. В Бета-тяжах 150.0° и 2.96Å соответственно. Согласно теории угол в водородной связи составляет 180 ± 25°. Углы в нашем белке несколько меньше. Это может быть связано со взаимоотталкиванием структур в молекуле. Длинна связи же обычно составляет от 2.8Å до 3.5Å. В этом плане связи в молекуле согласуются с теорией.

Теоритические данные взяты из книги "Основы биохимии Ленинджера" Д. Нельсон, М. Кокс.
О самом белке можно прочитать на сайте PDB.