Карта локального сходства полипротеина вируса полиомиелита (P03300) и полипротеина вируса ящура (P03310)
| Лучшие выравнивания | ||||
| Identities | Positives | Length | Gaps | Score (Bits) |
|---|---|---|---|---|
| Protease 3C. and RNA-directed RNA polymerase
Picornain 3C. and RNA-directed RNA polymerase 3D-POL* |
||||
| 29% | 48% | 615 and 644 | 55 | 646 (253) | Protein 2B. and Protein 2C.** |
| 30% | 44% | 410 and 431 | 73 | 400 (158) |
** - Во втором выравнивании ситуация та же, что и в первом, но на этот раз ID белков начинаются одинаково.
Сравнение веса выравнивания со случайным
| ID | Score | Median | Upper quartile | Bits | Probability of getting the same alignment |
|---|---|---|---|---|---|
| Гомологичных белков | |||||
| ACNA_ECOLI ACNA_BACSU | 2647.5 | 84.5 | 93.0 | 302,53 | 8.5×10-92 |
| Не гомологичных белков | |||||
| ACNA_ECOLI FUMC_BACSU | 57.0 | 60.5 | 67.75 | 0,52 | 0,697 |
Поиск гомологов 4-alpha-glucanotransferase в банке Swiss-prot
| ID | AC | Organism | Identities | Positives | Length | Gaps | Score (Bits) | Expect | Query cover |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MALQ_THETH | O87172.1 | Thermus thermophilus | 49% | 63% | 490 and 495 | 11 | 1206 (469) | 6×10-161 | 96.6% |
| MALQ_SYNY3 | P72785.1 | Synechocystis sp. PCC 6803 substr. Kazusa | 45% | 62% | 493 and 498 | 5 | 1114 (433) | 5×10-147 | 97.2% |