Выравнивания последовательностей белков К12 Кишечной палочки и 168 Сенной палочки

Глобальное парное выравнивание гомологичных белков

Protein Name	ID 1	ID 2	Score	% Identity	% Similarity	Gaps	Indels
DNA topoisomerase 1	TOP1_ECOLI	TOP1_BACSU	1353.5	34.7	47.8	214	16
Aconitate hydratase A	ACNA_ECOLI	ACNA_BACSU	2647.5	56.4	71.7	18	6
Fumarate hydratase class II	FUMC_ECOLI	FUMC_BATCSU	1505.0	63.0	76.9	5	4

Локальное парное выравнивение гомологичных белков

Protein Name	ID 1	ID 2	Score	% Identity	% Similarity	Gaps	Indels	Coverage 1 %	Coverage 2 %
DNA topoisomerase 1	TOP1_ECOLI	TOP1_BACSU	1357.0	40.2	55.4	94	14	85.0	99.4
Aconitate hydratase A	ACNA_ECOLI	ACNA_BACSU	2647.5	56.6	71.9	16	5	100	99.8
Fumarate hydratase class II	FUMC_ECOLI	FUMC_BATCSU	1512.0	64.0	78.3	1	1	98.5	99.1

Глобальное и локальное выравнивание негомологичных белков

Aligment type	ID 1	ID 2	Score	% Identity	% Similarity	Gaps	Indels	Coverage 1 %	Coverage 2 %
Global	ACNA_ECOLI	FUMC_BACSU	34.5	6.9	11.8	805	19
Local	ACNA_ECOLI	FUMC_BACSU	57.0	18.2	35.2	56	6	43.5	67.3

Глобальное выравнивание белков FUMC_ECOLI и FUMC_BATCSU в виде проекта Jalview

Множественное выравнивание белков

Проект Jalview. Всего в базе Swiss-Prot 85 белков с мнемоникой FUMC_*. Из них было выбрано семь: FUMC_MYCTU, FUMC_RICPR, FUMC_RHIME, FUMC_SULSO, FUMC_PSESM, FUMC_BACSU, FUMC_ECOLI. Все белки выровнялись хорошо, наблюдается множество консервативных участков. Самым отдалённым по происхождению, по моему мнению, является FUMC_SULSO. Он заметно короче своих родственников и на многих участках лишь у него произошла замена.