Секвенирование по Сенгеру

Упражнение 1. Чтение хроматограмм

Исходные прочтения: прямое и обратное
Обработанные прочтения: прямое и обратное
Jalview проект в выравниванием
Итоговая последовательность

Проблемные участки

В данном участке программа не определила нуклеотиды, но они легко определяются по пикам и обратной цепи.
Здесь в обратной цепи пик оказался настолько слабым, что был определён как шум.
В этом месте явно неправильно легла краска. Правильные нуклеотиды можно восстановить по прямому прочтению.
Тут снова лишние пятна. Восстановить легко по второй цепи.

Характеристика

Упражнение 2. Нечитаемые фрагменты

В этой хроматограмме большие проблемы с краской гуанина и шумом. Можно лишь предположить в некоторых участках реальную структуру, как это сделано выше.