Качество сборки генома Домашней кошки
- Домашняя кошка - Felis catus (domestic cat)
- Всего 2 сборки генома
- Для сборки "GCA_000181335.4"
- Общая длина - 2,521,863,845
- Скаффолды - 4,525
- Контиги - 4,909
- N50 - 41,915,695
- L50 - 19
- Аннотированные белки - 54726
- Публикация
- Последовательность одного из контигов
Ключи особенностей
- CDS - кодирующая последовательность
405..1934
/operon="gal"
/gene="galA"
/product="galactose permease"
/function="galactose transporter" - repeat_region - повторяющийся участок генома
80..401
/rpt_type=DISPERSED
/rpt_family="Alu-J" - tRNA - транспортная РНК
928..998
/product="tRNA-Phe" - regulatory - участок регулирующий транскрипцию, трансляцию или репликацию.
723..746
/gene="sod"
/regulatory_class="terminator" - gene - участок, определённый как ген
95..746
/gene="sod" - rep_origin - ориджин репликации
6
/direction=LEFT
/note="ori" - sig_peptide - сигнальная пептидная последовательность
1..54
/gene="TCR1A"
Геномный проект
| Название проекта | The 100,000 Genomes Project |
| Цель | Создание службы геномной медицины для Национальной службы здравоохранения Англии |
| Год начала | 2012 |
| Страница проекта | |
| Организация | Правительство Великобритании |
| Страна | Великобритания |
| Планируемое число геномов | 100 000 |
| Год завершения | - |
| Геномов на 2018 год | 87 231 |
| Последняя публикация | |
Митохондриальные гены
- Поиск в ENA. " tax_tree(2763) AND mol_type="genomic DNA" AND topology="CIRCULAR" AND organelle="mitochondrion" "
- Release - 100, Update - 0
- Представитель - Porphyra purpurea (AF114794.1)
- Таблица