Работа с KEGG PATHWAY и KEGG REACTION

Общие сведения о метаболическом пути "Метаболизм Серы"

Сера является важным элементом жизни, а метаболизм органических соединений серы играет важную роль в глобальном цикле серы. Сера встречается в различных степенях окисления: от +6 в сульфате до -2 в сульфиде. Восстановление сульфата может происходить как в ассимиляционном пути, потребляющем энергию, так и в диссимиляционном пути, продуцирующем энергию. Оба пути начинаются с активации сульфата реакцией с АТФ с образованием аденилатсульфата (АФС). В ассимиляционном пути APS превращается в 3'-фосфоаденилилсульфат (PAPS) и затем восстанавливается до сульфита, а сульфит далее восстанавливается до сульфида ассимилирующей сульфитредуктазой. В пути диссимиляции APS непосредственно восстанавливается до сульфита, а сульфит далее восстанавливается до сульфида диссимилирующей сульфитредуктазой.


Рисунок 1. Метаболизм Серы. map00920

Данный метаболический путь связан с четырьмя другими (отмечены цветами на Рис 1):

Метаболический путь "Метаболизм Серы" в разных доменах жизни

Организмы:

Рисунок 2. Homo sapiens



Рисунок 3. Dactylococcopsis salina



Рисунок 4. Methanococcus voltae


Как видно из Рисунка 2, у человека есль лишь небольшая чать ферментов необходимых для данного пути. Однако они образуют цепи, что позволяет предположить, что часть механизмов реализуется. Напимер превращение Сульфида в Сульфат.
На Рисунке 3, у бактерии заметно больше ферментов, учавтвующих в метаболизме. Они образуют цепи последовательных реакций, а также она полностью реализует Ассимиляционный путь восстановления серы.
А вот у археи (Рисунок 4) всего два фермента, и скорее всего с метаболизмом серы они в ней не связаны.

Реакция окисления диметилсульфоксида в базе данных KEGG

Идентификатор реакции R09498. (Отмечена рыжим на Рисунке 1)

Рисунок 5.