Примеры контактов между боковыми группами а.о.

1. Пример гидрофобного контакта

На картинке изображен остаток фенилаланина (номер 46 в цепи A) и а.о., образующие с ним гидрофобные контакты. Этот остаток фенилаланина образует больше
гидрофобных контактов, чем все другие остатки фенилаланина в белке - 11.

(Были выбраны неполярные а.о., расстояние от атомов R-цепей которых до атомов R-цепи PHE46:A меньше 4.5 Å .

2. Примеры водородных связей между боковыми группами

NH - N
На картинке изображены а.о., атомы которых образуют между собой водородную связь. Атом NE аргинина является донором водорода, атом NE2 гистидина - акцептором. Считается, что между этими атомами существует водородная связь, т.к. они входят соответственно в группы доноров - акцепторов, расстояние между ними меньше 3.5 Å .

OH - O
Атом OG1 треонина является донором водорода, атом OD1 аспарагина - акцептором.

3. Примеры дисульфидных мостиков

Белок инсулин. В шарнирной модели показонны а.о., образующие связи "дисульфидный мостик".

Один из дисульфидных мостиков инсулина.