Торсионные (двугранные углы)

Таблица. Измерение торсионных углов остатка HIS22 в белке PHOT_BACSU, цепь А



Название
двугранного
угла 		Угол определяется по координатам атомов
(обращение к атому в соответствие с синтаксисом RasMol,
в скобках - название атома) 		Данный угол описывает
поворот вокруг связи 		Результат измерения
с помощью RasMol
φ
  1. ASP21:A.C (карбонильный углерод 21-го остатка цепи А)
  2. HIS22:A.N (атом амидного азота 22-го остатка цепи А)
  3. HIS22:A.CA (ц-альфа атом 22-остатка цепи А)
  4. HIS22:A.C (карбонильный углерод 22-го остатка цепи А)
Ni - C&alphai -113.08
ψ
  1. HIS22:A.N (атом амидного азота 22-го остатка цепи А)
  2. HIS22:A.CA (ц-альфа атом 22-остатка цепи А)
  3. HIS22:A.C (карбонильный углерод 22-го остатка цепи А)
  4. VAL23:A.N (атом амидного азота 23-го остатка цепи A)
C&alphai - Ci 86.05
ω
  1. HIS22:A.CA (ц-альфа атом 22-остатка цепи А)
  2. HIS22:A.C (карбонильный углерод 22-го остатка цепи А)
  3. VAL23:A.N (атом амидного азота 23-го остатка цепи A)
  4. VAL23:A.CA (ц-альфа атом 23-остатка цепи А)
Ci - Ni+1 -179.06

Угол &phi


Пары значений углов фи и пси не могут быть абсолютно любыми. Они лежат в определенных границах. Это связанно с тем, что у а.о. есть боковые цепи, мешающие им принимать произвольные пространственные конфигурации.
Боковая цепь глицина - самая короткая. Тем не менее, и для значений фи и пси а.о. глицина существуют ограничения.
Значения углов фи большинства а.о., входящих в альфа-спираль, от -100 до -50 градусов. Углов пси - от -60 до 5 градусов.
Значения углов фи большинства а.о., входящих в бета-листы, от -160 до -60 градусов. Углов пси - от 90 до 180 градусов.

главная страница
©Настя Гуляева, 2009