| Характеристика паттерна | Паттерн | В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? | Все ли последовательности из Вашего выравнивания найдены? |
| Фрагмент последовательности | P-I-V-Y-V-N-Q-G-F-V-Q-M-T-G-Y | Только в последовательности белка PHOT_BACSU. | Только последовательность белка PHOT_BACSU. |
| Сильный | [NPY]-[IV]-[GILTV]-[EFHY]-[AGSV]-[LN]-[DEIPRTQ]-[AGLT]-F-[CELQRSV]-[DEFKNQRT]-[ILMQV]-[PST]-[AG]-[IY] | 30 | Не найдена последовательность белка FIXL_RHIME. |
| Слабый | {DEHKR}-[ILMV]-[GILTV]-[EFHY]-[AGSV]-[LN]-x-[AGILMTSV]-F-x(2)-[ILMNQV]-[PST]-[AG]-[IY] | 38 | Все. |
В каждой позиции сильного паттерна разрешены все буквы, встретившиеся в этой позиции, и только они.
Первая позиция сильного паттерна означает: "Asn или Pro или Tyr". Это непохожие по своим свойствам аминокислоты, которые объединяет то, что в нейтральной среде они не заряжены. Поэтому первая позиция слабого паттерна - "любой а.о., кроме заряженных в нейтральной среде".
Вторая, восьмая, двенадцатая позиции слабого паттерна дополнены родственными аминокислотами.
Седьмая, десятая, одиннадцатая позиции слабого паттерна представлены символом "x", т.к. соответствующие позиции сильного паттерна разрешают присутствие различных по свойствам а.о.
| Идентификатор документа PROSITE (AC) | Название мотива | Краткое описание мотива | Тип подписи (паттерн, профиль) | Паттерн (регулярное выражение) | Специфична ли подпись? | Сколько мотивов нашлось в белке? |
| PS00008 | MYRISTYL | N-myristoylation site | паттерн | G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P} | неспецифична | 1 |
| PS00006 | CK2_PHOSPHO_SITE | Casein kinase II phosphorylation site | паттерн | [ST] - x(2) - [DE] | неспецифична | 5 |
| PS00001 | ASN_GLYCOSYLATION | N-glycosylation site | паттерн | N - {P} - [ST] - {P} | неспецифична | 2 |
| PS00005 | PKC_PHOSPHO_SITE | Protein kinase C phosphorylation site | паттерн | [ST] - x - [RK] | неспецифична | 2 |
| PS50112 | PAS | PAS repeat | профиль | профиль | специфична | 1 |
| PS50113 | PAC | PAC domain | профиль | профиль | специфична | 1 |
| PS50801 | STAS | STAS domain | профиль | профиль | специфична | 1 |