Программа MEME

1. Поиск мотивов в наборе гомологов белка PHOT_BACSU программой MEME.


№ мотива во всех ли последовательностях нашелся? координаты в последовательности PHOT-BACSU P-value в последовательности PHOT-BACSU длина мотива (width) относительная энтропия мотива
1 да 35-76 4.28e-42 41 110.7 bits
2 мотив отсутствует у FIXL_RHIME 78-112 2.95e-31 34 88.9 bits
3 мотив отсутствует у AER_ECOLI 114-141 1.01e-20 27 62.1 bits

2. Первый и третий мотивы не выровнены ( motifs.msf ).


3. Первый, второй и третий мотивы в последовательностях, входящих в seed для домена PAS.



главная страница
©Настя Гуляева, 2010