# Ответы к упражн.3
# Картинка с изображением всех подписей в Вашем белке.
# Таблица к упражн. 4.
Упражнение 3. Опишите документ InterPro.
Откройте главную страничку БД InterPro.
Проведите поиск документов по AC или ID UniProt Вашего белка.
Из списка полученных записей выберите ту, которая содержит наибольшее количество подписей (поле "Signatures")
Изучите формат документа InterPro, в отчет занесите
* идентификатор документа;
* его полное название;
* общее количество белков, в которых обнаружены соответствующие мотивы.
*Если данная подпись находится в отношениях родства или вложенности с другими подписями, опишите эти отношения, для отношений родства, приведите дерево.
Упражнение 4. Опишите все подписи в Вашем белке, собранные в БД InterPro.
Найдите полное описание всех известных подписей в аминокислотной последовательности Вашего белка, см.подсказку.
Создайте графический файл с изображением всех мотивов в последовательности, см.подсказку.
Структурные мотивы не рассматриваем!!
Далее заполните табличку.
Название подписи
Положение в последовательности Хххх_Ecoli
Полное название базы данных
* Название организации, поддерживающей данную БД.
* Город и страна
NUCLEAR_REC_DBD_1
25-105
PROSITE
Swiss Institute of Bioinformatics
Швейцария, Женева
Формат отчета
Откройте главную страничку БД InterPro.
Проведите поиск документов по AC или ID UniProt Вашего белка.
Из списка полученных записей выберите ту, которая содержит наибольшее количество подписей (поле "Signatures")
Изучите формат документа InterPro, в отчет занесите
* идентификатор документа;
* его полное название;
* общее количество белков, в которых обнаружены соответствующие мотивы.
Database ID Name Proteins
PANTHER PTHR11986:SF14 BioA 226
TIGRFAMs TIGR00508 bioA 239