Третий семестр

Тема третьего семестра "Работа с последовательностями и структурами нуклеиновых кислот"

Целью стоит научиться работать с банками нуклеотидных последовательностей, с пространственными структурами нуклеиновых кислот, а также получить первое представление о методах поиска кодирующих участков и слабых сигналов в последовательностях НК.

Блок 1: Последовательности нуклеиновых кислот

• Банк EMBL
• Пакет BLAST (работа из командной строки)
• Поиск сходных нуклеотидных последовательной, не кодирующих белки
• Аннотирование фрагмента генома Klebsiella pneumoniae (зачетное занятие)

Блок 2: Структуры нуклеиновых кислот

• Работа в ChemSketch: построение фрагмента ДНК
• Работа с RasMol и 3DNA: анализ структур A- и B-форм ДНК
• Структура РНК
• Белок-нуклеиновые контакты

Блок 3: Предсказание генов у эукариот

Блок 4: Поиск сигналов