Метаболические пути. KEGG.

1. Поиск графических формул и идентификаторов заданных низкомолекулярных веществ в KEGG.

   Было полученно задание: Какая аминокислота может превращаться в бета-аланин?
   Идентификатор бета-Аланина - C00099

   Структура бета-Аланина (beta-Alanine)
   

2. Поиск метаболического пути. Выделение цветом пути превращения заданных веществ.

   Для заданнной задачи был выбран путь из Метаболизма бета-Аланина.
   Текст запроса:

   C00099 red
   4.1.1.15 yellow
   4.1.1.11 yellow 

   Метаболизм бета-Аланина (участок карты)
   
   На карте красным обозначен бета-Аланин, желтым ферменты реакции превращения Аспарагиновой кислоты в бета-Аланин.

3. Исследование выбранного метаболического пути.
   • Описание выбранного пути
     Возможный путь превращения Аспарагиновой кислоты (L-Aspartate) в бета-Аланин (beta-Alanine)

     Этап	Ферментативная реакция	Фермент
     1	L-Aspartate <=> beta-Alanine + CO2	4.1.1.11 или 4.1.1.15

     
     
   • Возможна ли выбранная цепочка реакций у конкретных организмов?

     Организм	Возможно ли определить из какой аминокислоты можно получить бета-Аланин по данным KEGG ?	Краткое обоснование
     Homo sapiens	Да	Найден ген только для фермента 4.1.1.15
     Escherichia coli	Да	Найдены гены для обоих ферментов
     Pseudomonas aeruginosa PAO1	Да	Найден ген только для фермента 4.1.1.11
     Methanococcus janaschii	Нет	Вообще отсутствует карта для данного метаболического пути