Практикум 5

Описание взаимодействий между аминокислотными остатками (2YJP) Pymol

H-связи в остове белка

Рис. 1 Водородная связь, затрагивающая атомы остова белка в альфа-спиралях и бета-слоях

Рис. 2 Водородные связи в антипараллельном бета-слое

H-связи в боковых радикалах

Рис. 3 Водородная связь, затрагивающая атомы боковых радикалов аминокислот

Солевые мостики

Рис. 4 Солевые мостики

В образовании солевых мостиков принимают участие положительно (K, R, H) и отрицательно заряженные (D, E) аминокислоты.

Дисульфидные связи

Рис. 5 Расположение цистеинов в белке (показаны желтым)

В структуре 2YJP нет дисульфидных связей.

Стекинг

Рис. 6 Ароматические кольца белка

В структуре 2YJP есть стекинг взамодействия между аминокислотами F, H, W.