AC: PF00240 Summary name: Ubiquitin family
Seed: 60 Full: 53635
Structures: 1954 Функции:Белки из этого семейства содержат характерный мотив из пяти аминокислот, называемый протеасомно-взаимодействующим мотивом, который может играть биологически значимую роль в доставке белков к протеасомам и привлечении протеасом к участкам транскрипции. Таксономия:Большего всего белков этого семейства относятся к эукариотам и лишь малая часть к бактериям, вирусам и археям. Таблица 1
Карта локального сходства двух последовательностей с одним и тем же доменом, но с разной доменной архитектурой
Доменная архитектура 1: PF00240 - PF00240 Доменная архитектура 2: PF01805 - PF01805 - PF12230 - PF00240
Таблица 2 Рис. 1 Dot PlotDot Plot показывает наличие дупликации, первая диагональная линия означает сопадение первого домена доменной архитектуры 1 с последним доменом доменной архитектуры 2, а вторая линия совпадение со вторым доменом доменной архитектуры 1 соответственно. Между линиями есть небольшое расстояние, оно возникает из-за того, что домены расположены не вплотную, они разделены участком аминокислот.