Результаты изучения записи IPR001226 (идентификатор) в интегрированной
базе данных InterPro.
Последовательность действий:
на домашней страничке InterPro была найдена кнопка "Sequence Search",
на открывшейся страничке вставлена последовательность интересующего меня белка
в формате FASTA в соответствующее окно
(при этом галочки должны были стоять против всех предлагаемых способов поиска).
Среди найденных документов был выбран первый в списке и открыт.
Было определено:
- на основании каких подписей и из каких баз данных создана эта запись в
InterPro:
Создание этой записи основано на существовании следующих подписей (signature):
База данных |
Идентификатор подписи |
Число белков с данной подписью |
Prosite |
PS00201 |
210 |
- к какому числу белков и из каких таксонов относится данная запись:
Такое семейство (FLAVODOXIN) встречается в Virus, Archaea, Bacteria,
Cyanobacteria, Green Plants и т.д.
Эта запись относится ("метит") 91 белок.
- имя и тип записи (что это, семейство, домен или сайт или??):
Тип записи Family (семейство).
Запись IPR001226 называется Flavodoxin.
- есть ли у данной записи родственные записи (отношения parent/child,
found in/contains):
таковых не оказалось.