Поиск мотивов в последовательности FLAV_ECOLI с помощью средств PROSITE.
В базе данных PROSITE собрана коллекция сайтов, мотивов и доменов. Они описаны с помощью паттернов и, в некоторых случаях, профилей-PSSM.Идентификатор паттерна (accession number) | Идентификатор документации PROSITE и краткое описание или название паттерна в соответствии с этим документом | Паттерн (регулярное выражение ) | Число мотивов, обнаруженных в белке |
PS00003* | PDOC00003 :сайт сульфатирования тирозина. |
|
2 |
PS00005* | PDOC00005 : сайт фосфорилирования протеинкиназой С(protein kinase C phosphorylation site). | [ST]-x-[RK] | 2 |
PS00006* | PDOC00006 : сайт фосфорилирования казеинкиназой(сasein kinase II phosphorylation site). | [ST]-x(2)-[DE] | 4 |
PS00008* | PDOC00008 : сайт N-миристоилирования(N-myristoylation site). | G-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P} | 3 |
PS00201 | PDOC00178 : Flavodoxin signature (подпись). | [LIV]-[LIVFY]-[FY]-x-[ST]-x(2)-[AGC]-x-T-x(3)-A-x(2)-[LIV] | 1 |
PS50902** | PDOC50902 : похожий на флаводоксин домен (flavodoxin-like domain). | Есть профиль, но нет паттерна. | 1 |