1) Таблица. Измерение торсионных углов остатка GLU10 в белке 1UX8_BACSU, цепь А
Название
двугранного
угла |
Угол определенный по координатам атомов |
Данный угол описывает
поворот вокруг связи |
Результат измерения
с помощью RasMol |
| φ |
- 1.TUR9:C.C 23 (карбонильный углерод 9-го остатка цепи А)
- 2.GLU10:C.N 33(азот пептидной связи между 9 и 10 остатками)
- 3.GLU10:C.CA 34 (альфа углеродный атом глицина (10))
- 4.GLU10:C.C 35(карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
|
Ni — C&alphai
|
-63.15
|
| ψ |
- 1.GLU10:C.N 33 (азот глицина (10))
- 2.GLU10:C.CA 34 (альфа углеродный атом глицина(10))
- 3.GLU10:C.C 35 (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
- 4.ALA11:C.N 42 (азот аланина(11))
| C&alphai — Ci
|
-24.48 |
| ω
|
- 1.GLU10:C.CA 34 (альфа углеродный атом глицина(10))
- 2.GLU10:C.C 35 (карбонильный углерод 10-го остатка цепи А)
- 3.ALA11:C.N 42 (азот аланина (11))
- 4.ALA11:C.CA 43 (альфа углеродный атом аланина (11))
|
Ci — Ni+1
| 175.31 |
2) Изображение торсионного угла
3) Карты Рамачандрана
a) Для альфа-спирали:
b) Для глицина:
c) Для всех остатков:
