Практикум 1

Информация о белке

Polyribonucleotide nucleotidyltransferase

Мой белок - полирибонуклеотид нуклеотидилтрансфераза.
Участвует в деградации мРНК.
Катализирует фосфоролиз в одноцепочечных полирибонуклеотидных последовательностях в 3'- 5' направлении.
Также участвует, вместе с РНКазой II, в процессинге тРНК. [1] [2]

Таблица 1 Описание белка (полирибонуклеотид нуклеотидилтрансферазы) из генома бактерии.

Параметр	Значение
Идентефикатор белка	ALV20907.1
Идентефикатор фрагмента генома	NY10_286
Координаты гена в геноме	244129..246237
Длина гена (п. н.)	2108
Цепь (прямая или обратная)	прямая
Длина белка (в аминокислотных остатках)	702

Здесь содержится аминокислотная последовательность описанного полипептида этой бактерии.

>ALV20907.1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 
MTKKQVFTKEWAGRTLTVEVGQLAKQASGAALIRYGDTAVLSASVASKKAKDVDFFPLTV
NYEEKMYSVGKIPGGFIKREGRPSEAATLTARLIDRPIRPMFADGFRNEVQVTNTVMSVD
QNCSPSFAAMFGSSLSLVISDIPFDGPIAGVDVGRVDGEYIINPTVEQEAVSDIHLTVAG
TKEAINMVESGAKEVSEEDMLGALLFGHNAIKELVAFQEEIQAAVGKEKSEVSLLQVDAD
LEKEINAAYKEKMSIAIKTEEKLAREVNIEAVKEEAILFYQEEYKEHEEAGRINKEIKKI
VEDMEKDEVRRLITVDKIRPDGRKIDEIRSLASEIGILPRTHGSGLFTRGQTQALTIATL
APLGEHQIIDGLGIEESKRFIHHYNFPQFSVGSTGPNRGPGRREIGHGALGERALSQVIP
NEEEFPYMIRLVSEVLESNGSSSQASICAGTLALMDAGVPIKAPVAGIAMGLVMEGENYT
VLTDIQGLEDHLGDMDFKVAGTTAGITALQMDIKIQGITPQILEEALSQAKKARLEILDE
LVSTIAEPHKELSKYAPKIEMMQIKPEKIKVVIGRGGDQINAIIEETGVKIDIDQEGKIS
IASEDAAMIKRAKDIIKELTQDIEIGKVYKGKVKRIEKFGAFVEIAKGKDGLVHISELAN
ERVGKVEDVLALDELIDVKVIEIDKQGRINLSRKALLKKEED

Рис.1. Геномное окружение гена, кодирующего этот белок

Источники

[1] ProteinPolyribonucleotide nucleotidyltransferase
[2] NCBI database