| Латинское название вируса | Bat sapovirus TLC58/HK |
| Русское название вируса | Саповирус летучей мыши |
| Количество фрагментов в полном геноме | 1 |
| Общая длина генома (п.н.) | 7696 |
| Количество белков | 1 (нарезается на 14) |
Классификация:
Род Sapovirus является родом семейства Caliciviridae, представители которого, как известно, вызывают кишечные заболевания у людей и животных. Существует значительное генетическое разнообразие среди Саповирусов, которые классифицируются на различные геногруппы на основе филогенетического анализа полной последовательности капсидного белка. В то время как несколько видов млекопитающих, включая человека, свиней, норок и собак, были сразу идентифицированы как хозяева для Саповирусов, не было никаких сообщений о Саповирусах летучих мышей, несмотря на их биологическое разнообразие. Полный геном саповируса SAV штамма TLC58 летучей мыши (Genbank, инвентарный номер JN899075 ) составляет 7696 нп в длину и имеет геномную содержание G + C 60,2% мол. Длина и содержание G + C , летучей мыши SAV генома, значительно выше , чем у других известных SAVS. Каждый ген содержит 3 перекрывающихся ORF , сравнимыми с организацией генома SAVS в GI, GIV и GV. 5'-UTR и 3'-UTR 9 нп и 225 нп длиной, соответственно. Длина 3'-UTR, значительно больше, чем у других SAVS. [1]
Ниже приведена последовательность самого маленького белка - Calicivirus coat protein:
>YP_006347581.1 VP2 Calicivirus coat protein MGSWTQGMIGLAGFTVDAITGLGALGVQAQNAETNRQLATLQAEALKQQLAANKLSMEQW EKINNPASMLSSATAAGFDPVAAMQIASRGTVSRWHGGVQLAPLSQVQVDGLRGTALARA GLQAGGTFTTGVRGPYRLQAGRPVYRRDSISSWAESTSTMSTRVRSPSVTSASSSGSSTS SLGPRPVVVIPGSTSATWVPGSEA |
Источники:
[1] Herman Tse, Wan-Mui Chan, Kenneth S. M. Li, Susanna K. P. Lau, Patrick C. Y. Woo and Kwok-Yung Yuen, Discovery and Genomic Characterization of a Novel Bat Sapovirus with Unusual Genomic Features and Phylogenetic Position, 2012
© Anastasia Cherkashina 2016