Главная Семестры Проекты Обо мне

Белок в Uniprot



1. Документ успешно извлечен c помощью команды sw:engb_bacsu

2. Заполним таблицу

Code(метка)

Content

Описание

Мой белок

ID

Identification

Идентификатор последовательности, часто кодирует биологически осмысленную информацию, меняется от выпуска к выпуску БД

ENGB_BACSU

AC

Accession number(s)

"Код доступа" — уникальный идентификатор последовательности, не меняющийся от выпуска к выпуску БД

P38424

DT

Date

Дата создания записи и последней модификации

01-OCT-1994, integrated into UniProtKB/Swiss-Prot.
01-OCT-1994, sequence version 1.
25-JAN-2012, entry version 91.

DE

Description

Название (краткое описание) белка, часто указывающее на его функцию

RecName: Full=Probable GTP-binding protein EngB

GN

Gene name(s)

Имя гена (-ов), кодирующего белок

Name=engB; Synonyms=ysxC; OrderedLocusNames=BSU28190

OS

Organism species

Организм, в котором найден белок

Bacillus subtilis

OG

Organelle

Если ген белка не находится в хромосоме

ген моег белка находится в хромосоме

OC

Organism classification

Полная таксономия организма

Bacteria; Firmicutes; Bacillales; Bacillaceae; Bacillus.

OX

Taxonomy cross-reference(s)

Идентификатор таксона

NCBI_TaxID=1423

RN

Reference number

Номер ссылки на научную публикацию

[1]

RP

Reference position

Тип информации в данной ссылке и фрагмент последовательности, к которому она относится.

NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]

RC

Reference comment(s)

Комментарии к цитируемой работе

STRAIN=168 / IS58

RX

Reference cross-reference(s)

Библиографические перекрестные ссылки, например, идентификатор PubMed

MEDLINE=95050209; PubMed=7961402

RA

Reference authors

Авторы публикации

Riethdorf S., Voelker U., Gerth U., Winkler A., Engelmann S., Hecker M.

RT

Reference title

Название статьи

"Cloning, nucleotide sequence, and expression of the Bacillus subtilis lon gene."

RL

Reference location

Журнал, книга или устное сообщение

J. Bacteriol. 176:6518-6527(1994)

CC

Comments or notes

Комментарии

смотрите тут

DR

Database cross-references

Гиперссылки на соответствующие записи других БД

смотрите тут

PE

Protein existence

Как получена информация о существовании данного белка

1: Evidence at protein level

KW

Keywords

Ключевые слова (индексируемый предметный указатель)

3D-structure; Cell cycle; Cell division; Complete proteome; GTP-binding; Nucleotide-binding; Reference proteome; Septation

FT

Feature table data

Описание особых позиций в последовательности, особенности последовательности

смотрите тут

SQ

Sequence header

Метка начала последовательности и некоторых ее общих свойств (в частности, молекулярной массы)

SEQUENCE 195 AA; 22026 MW; 12EC561C1806FFE3 CRC64

(blanks)

Sequence data

Аминокислотная последовательность

MKVTKSEIVI SAVKPEQYPE GGLPEIALAG RSNVGKSSFI NSLINRKNLA RTSSKPGKTQ
TLNFYIINDE LHFVDVPGYG FAKVSKSERE AWGRMIETYI TTREELKAVV QIVDLRHAPS
NDDVQMYEFL KYYGIPVIVI ATKADKIPKG KWDKHAKVVR QTLNIDPEDE LILFSSETKK
GKDEAWGAIK KMINR



3. Ответ на вопрос (я выбрала вопрос №9)

Какой функции этого белка посвящена одна из статей, упомянутых в записи?
Полное имя моего белка - Probable GTP-binding protein EngB, имя гена - engB или ysxC. В статье написано, что ysxC ген имеет важное значение для выживания микроорганизмов и, следовательно, может представлять собой мишень для развития новейшей конструкции антибактериального средства. B.subtilis YsxC является членом фактора трансляции, связывающий GTPases класс и его кристаллическую структуру в форме АПО и в комплексе с GDP и GMPPNP/Mg2+.

4. Заполним еще одну табличку

Команда/Запрос Число записей в SwissProt Число записей в TrEMBL
engb_bacs*
2
2
"normal cell division" AND "normal septation"
541
2539
"Essential for growth"
169
221

©Melnichuk Anastasia