Протеомы

Протеом Escherichia coli K12
Идентификатор протеома:UP000000625
Количество последовательностей: 4313
Количество аминокислотных остатков:1351619
Протеом Xanthomonas oryzae MAFF 311018
Индентификатор протеома:UP000001957
Количество последовательностей: 4204
Количество аминокислотных остатков:1349171


Таблица 1. Частота аминокислот в протеомах.
АминокислотаПроцент в протеоме Xanthomonas oryzae MAFF 311018Процент в протеоме Escherichia coli K12Разность процентов
A12,70425 9,511556 3,1927
L10,72829 10,67579 0,0525
G8,102679 7,370494 0,7322
R7,690574 5,518641 2,1719
V7,294628 7,070373 0,2261
S5,596177 5,796678 0,2005
D5,587653 5,149158 0,4385
P5,295029 4,428319 0,8667
T5,183257 5,39405 0,2108
E4,825704 5,765974 0,9403
Q4,575106 4,443412 0,1317
I4,020098 6,00983 1,9897
F3,158977 3,892665 0.7337
K2,951516 4,405753 1,4542
N2,629392 3,936908 1,3075
H2,505503 2,267725 0,2345
Y2,328245 2,844663 0,5164
M2,185416 2,822541 0,6371
W1,624405 1,531867 0,0925
C1,016402 1,160904 0,1445
В протеоме обеих бактерий наиболее часто встречающимися аминокислотами являются A (аланин), L(лейцин), и G(глицин), хотя в протеоме Xanthomonas oryzae наиболее часто встречающимся является аланин, а в протеоме Escherichia coli - лейцин. В протеоме X.oryzae наиболее редкими являются M(метионин) W(триптофан) C(цистеин), а в протеоме E.coli - H(гистидин), W(триптофан) и C(цистеин): то есть 2 из 3 наиболее редко встречающихся аминокислот совпадают.Наибольшая разница во встречаемости аминокислоты в пользу X.oryzae - у A(аланина)(3,1927%), а в пользу E.coli - у I(изолейцина)(1,9897%).
Ссылка на excel-таблицу

©Кондратенко Наталья, 2017