| |
| Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре |
| # | Имена атомов | Длина связи(А) | Угол N-O-C(°) |
Альфа-спирали |
| 1 | N(1654MET) - O(1650SER) | 2.82 | 151.0 |
| 2 | N(1652GLY) - O(1648GLN) | 3.25 | 141.6 |
| 3 | N(1655LEU) - O(1651THR) | 2.97 | 159.2 |
| 4 | N(1658LEU) - O(1654MET) | 2.88 | 155.3 |
Бета-тяжи |
| 1 | N(1596PHE) - O(1435ILE) | 2.86 | 159.9 |
| 2 | N(1435ILE) - O(1596PHE) | 2.99 | 145.6 |
| 3 | N(1598ILE) - O(1433GLY) | 2.74 | 150.7 |
| 4 | N(1433GLY) - O(1598ILE) | 2.81 | 142.4 |
| Таблица 1.Параметры водородных связях в альфа-спиралях и бета-тяжах. |
|
В таблице 1 приведены данные о длинах водородных связей и угле N-O-C в альфа-спиралях и бета-тяжах. Средняя длина водородной связи в альфа-спирали - 2.98 А, средний угол - 151.775°. В бета-тяже - 2.85 А и 149.65° соотвественно. Значения отличаются не сильно. Водородная связь достигает наибольшей силы при угле N-O-C равном 180°, но это значение не достигается в рассмотренных нами структурах. Желательная длина водородной связи не должнат превышать 3.5 А. Это условие удовлетворяется.