Для составления филогенетического дерева нами были выбраны следующие протеобактерии
| Название | Мнемоника |
| Acidiphilium cryptum | ACICJ |
| Escherichia coli | ECOLI |
| Neisseria meningitidis | NEIMA |
| Paracoccus denitrificans | PARDP |
| Pasteurella multocida | PASMU |
| Saccharophagus degradans | SACD2 |
| Shewanella denitrificans | SHEDO |
На основании приведённого ниже филогенетического дерева, было составлено филогенетическое дерево (и его скобочная формула), состоящее только из приведённых выше протеобактерий.
Скобочная формула: (((((ECOLI, PASMU), SHEDO), SACD2), NEIMA), (ACICJ, PARDP))
Получившееся скобочное дерево:
Нетривиальные ветви дерева:
1. {ECOLI, PASMU} против {SHEDO, SACD2, NEIMA, ACICJ, PARDP}
2. {ECOLI, PASMU, SHEDO} против {SACD2, NEIMA, ACICJ, PARDP}
3. {ECOLI, PASMU, SHEDO, SACD2} против {NEIMA, ACICJ, PARDP}
4. {ECOLI, PASMU, SHEDO, SACD2, NEIMA} против {ACICJ, PARDP}