| На главную |
|
Мои проекты | Ссылки | Обо мне | Мои заметки |
Thioalkalivibrio sulfidophilus
Систематика [1]
| Таксон | Название таксона |
| Домен | Bacteria |
| Тип | Proteobacteria |
| Класс | Gammaproteobacteria |
| Порядок | Chromatiales |
| Семейство | Ectothiorhodosriraceae |
| Род | Thioalkalivibrio |
Общая характеристика
Рис.1 Микрофотография Thioalkalivibrio sp. (Фазово-контрастная микроскопия). a: Штамм, росший при pH=10 и концентрации Na+ 4 M, b: при pH=10 и концентрациях Na+ 0,4 M и K+ 3,6 M.[2]
Среда обитания
Cодовые озера.
В содовых озерах экстремально высокие для живых организмов
значения pH и солености. Thioalkalivibrio - первый пример облигатных хемолитоавтотрофов, способных расти в среде с высокой кислотностью и высокой концентрацией карбонат-ионов.
Общая характеристика бактерии
| Признак | Значение признака | Признак | Значение признака |
| Статус по Граму | Грамотрицательная | Форма клетки | Палочковидная |
| Подвижность | Подвижная | Образование спор | Неспорообразующая |
| Отношение к температуре | Мезофил, температурный оптимум 34 o C | Источники энергии | Сульфиды, полисульфиды, сера, тиосульфат |
| Жизненная форма | Свободноживущая | Патогенность | Непатогенна |
Помимо их роли в цикле серы содовых озер, играют ключевую роль в качественном удалении сульфида из сточных вод и газовых потоков.
Геном
Причина секвенирования генома
Геном был секвенирован из-за способности бактерии к удалению сульфидов из газовых отходов. Удаление
токсичного сульфида необходимо не только для очищения окружающей среды, но и для защиты газовых турбин от коррозии.
Информация о геноме
Тип хромосомы – кольцевая
Размер – 3464554 пар нуклеотидов
Число генов – 3283
Процент ДНК, занятый кодирующими последовательностями генов (CDS) – 87%
Содержание GC пар - 65,9%
PubMed
Статья на PubMed [3]
PMID: 21475584
Запрос: Thioalkalivibrio and sulfidophilus 2000/01:2012/10[dp]
Название статьи: Complete genome sequence of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7
Авторы: Gerard Muyzer,Dimitry Yu Sorokin, Konstantinos Mavromatis, Alla Lapidus, Alicia Clum,
Natalia Ivanova, Amrita Pati, Patrick d'Haeseleer, Tanja Woyke and Nikos C. Kyrpides
Аннотация
Thioalkalivibrio sulfidophylus HL-EbGr7 - облигатный хемолитоавтотрофная, галоалкалифильная, сероокисляющая бактерия, относящаяся к Гаммапротеобактериям. Штамм был найден, как преобладающий в биореакторе, удаляющем сульфид из биогаза. В этой статье мы рассказываем о полностью секвенированном геноме штамма HL-EbGr7. Геном был секвенирован в рамках Joint Genome Institute Community Sequencing Program, из-за значимости бактерии для устойчивого удаления сульфидов из биологический и промышленных газовых выбросов.
Это интересно...
Генетический анализ 85 штаммов, выделенных из разных щелочных озер в Монголии, Кении, Калифорнии, Египте и южной Сибири показал их высокое генетическое разнообразие и эндемичный характер – большинство найденных генотипов были уникальны в своем регионе.
Источники информации
[1] Европейский биоинформатический институт
[2] Статья "Complete genome sequence of Thioalkalivibrio sp. K90mix" на PubMed
[3] Статья "Complete genome sequence of “Thioalkalivibrio sulfidophilus” HL-EbGr7" на PubMed