Белки, выполняющие сходные функции с белком MntR Bacillus Subtilis

Для того, чтобы найти белки других организмов из Firmicutes, выполняющие сходные функции, в базу данных на сайте Европейского биоинформатического института были введены запросы, представленные в таблице 1.

Таблица 1 Запросы и число ответов в базе данных SwissProt.

Формулировка функции белка	Строка запроса	Количество найденных документов
Regulator of manganese homeostasis	(([swissprot-Description:manganese] & [swissprot-Description:regulator]) & [swissprot-Taxonomy:Firmicutes*])	32
Mediates repression [of the manganese transporter MntH] protein	([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & (([swissprot-AllText:repression] & [swissprot-AllText:transporter]) ! [swissprot-AllText:fragments]))	11
Activates the transcription of [the mntABCD] operon	([swissprot-Taxonomy:Firmicutes] & (([swissprot-AllText:activate] & [swissprot-AllText:transcription]) & [swissprot-AllText:operon]))	99

Последовательности десяти предполагаемых гомологов белка MntR Bacillus Subtilis в Fasta-формате
Из результатов третьего запроса были отобраны 10 последовательностей белков из организмов того же рода и 3х других родов. Их последовательности в Fasta-формате представлены здесь.

Дополнительную информацию о них можно узнать здесь .