Особенности аминокислотной последовательности белка MntR

К особенностям аминокислотной последовательности можно отнести места поворота цепи, сигнальные последовательности, альфа-спирали, бета-листы, места конфликтов (расхождение данных разных исследователей).
Для белка MntR Bacillus Subtilis не обраружено сигнальной последовательности, возможно, это связано с его локализацией в цитоплазме и, следовательно, отсутствием необходимости его куда-либо транспортировать. Особенности для этого белка:

1. Альфа-спирали.
1) 4-20 АК остатки, последовательность PSMEDYIEQI YMLIEEK
2) 25-32 АК остатки, последовательность VSDIAEAL
3) 36-48 АК остатки, последовательность PSSVTKMVQK LDK
4) 64-86 АК остатки, последовательность SKGKKIGKRL VYRHELLEQF LRI
5) 91-101 АК остатки, последовательность EEKIYNDVEG I
6) 102-104 АК остатки, последовательность EHH
7) 107-121 АК остатки, последовательность WNSIDRIGDL VQYFE
8) 124-134 АК остатки, последовательность DARKKDLKSI Q
9) 139-141 АК остатки, последовательность HHN

2. Бета-листы
1) 51-55 АК остатки, последовательностьYLIYE
2) 59-62 АК остатки, последовательность GLVL

3. Участок поворота
1) 56-58 АК остатки, последовательность KYR

4. Участок конфликта
1) 81 АК остаток, E->D (аспорагиновая кислота-аспарагин)

Список всех записей банка трехмерных структур PDB, относящихся к белку

PDB:2EV0, PDB:2EV5, PDB:2EV6, PDB:2F5C, PDB:2F5D, PDB:2F5E, PDB:2F5F, PDB:2HYF, PDB:2HYG, PDB:1ON1, PDB:1ON2, PDB:3R60, PDB:3R61

Более подробно с записями можно ознакомиться здесь

Источники:
[1] Статья на PubMed: "Conformational studies of the manganese transport regulator (MntR) from Bacillus subtilis using deuterium exchange mass spectrometry."