Филогенетические деревья

Выбранные бактерии:
НазваниеМнемоника
Bacillus subtilisBACSU
Clostridium tetaniCLOTE
Geobacillus kaustophilusGEOKA
Lactobacillus acidophilusLACAC
Lactococcus lactisLACLM
Listeria monocytogenesLISMO
Staphylococcus aureusSTAA1

Скобочная формула дерева

(CLOTE, ((LACAC, LACLM), (((BACSU, GEOKA), LISMO), STAA1)));

Изображение дерева

Создаю файл со скобочной формулой (расширение .tre) и открываю его программой MEGA.

Ветви дерева

Список нетривиальных ветвей как разбиений множества листьев:

1) {LACAC, LACLM} против {CLOTE, BACSU, GEOKA, LISMO, STAA1}

2) {BACSU, GEOKA} против {CLOTE, LACAC, LACLM, LISMO, STAA1}

3) {BACSU, GEOKA, LISMO} против {CLOTE, LACAC, LACLM, STAA1}

4) {BACSU, GEOKA, LISMO, STAA1} против {CLOTE, LACAC, LACLM}


© Ходыкина Наталья,2014