Практикум 1. Филогенетическое дерево.

Задание 1.

Отобранные бактерии

Скобочная формула дерева

(((PROMH,SHEDO),AROAE),(((BARHE,BRUSU),AGRFC),PARDP))

Изображение дерева

Ветви дерева

Дерево содержит 4 нетривиальные ветви:

1) {PROMH,SHEDO} против {AROAE,PARDP,BARHE,BRUSU,AGRFC}

2) {PROMH,SHEDO,AROAE,PARDP} против {BARHE,BRUSU,AGRFC}

3) {PROMH,SHEDO,AROAE,BARHE} против {BRUSU,AGRFC}

4) {PROMH,SHEDO,AROAE} против {BARHE, BRUSU, AGRFC,PARDP}

Практикум 2. Таксономия нетривиальных ветвей.

1) {PROMH,SHEDO} - класс Gammaproteobacteria против {AROAE,PARDP,BARHE,BRUSU,AGRFC}

2) {PROMH,SHEDO,AROAE,PARDP} против {BARHE,BRUSU,AGRFC} - ветвь, в которой не выделены такслны

3) {PROMH,SHEDO,AROAE,BARHE} против {BRUSU,AGRFC} - порядок Rhizobiales

4) {PROMH,SHEDO,AROAE} против {BARHE, BRUSU, AGRFC,PARDP} - класс Alphaproteobacteria