pano

Блоки выравнивания

Я выбрал домен с AC: PF15715, InterPro entry: IPRO31444, ID: Q15004 (PCNA-associated factor histone like domain). Число последовательностей в выравниваниях seed: 14, full: 303. В проекте Jalview я выделил красным цветом вертикальный плюс-блок, зелёным – частичный плюс-блок и синим – минус-блок.

Паттерн вертикального плюс-блока: [MQ][VAI][RK][TR][KH][ASD][DNSTG]

Паттерн частичного плюс-блока: [QPTRK][PEA][DE][PQICD][TESD][ESADT][DERK][GENDA][ESRDA]

Ссылка на проект Jalview