CAPP_ECOLI

Фосфоенолпируват карбоксилаза

(Phosphoenolpiruvate Carboxylase)

Краткое название белка: CAPP_ECOLI .
Полное название организма: Escherichia coli, K–12.
Название гена: ppc.
Номер локуса в бактериальной хромосоме: p00864.

Последовательность аминокислотных остатков:

>CAPP_ECOLI description
MNEQYSALRSNVSMLGKVLGETIKDALGEHILERVETIRKLSKSSRAGNDANRQELLT
TLQNLSNDELLPVARAFSQFLNLANTAEQYHSISPKGEAASNPEVIARTLRKLKNQPE
LSEDTIKKAVESLSLELVLTAHPTEITRRTLIHKMVEVNACLKQLDNKDIADYEHNQL
MRRLRQLIAQSWHTDEIRKLRPSPVDEAKWGFAVVENSLWQGVPNYLRELNEQLEENL
GYKLPVEFVPVRFTSWMGGDRDGNPNVTADITRHVLLLSRWKATDLFLKDIQVLVSEL
SMVEATPELLALVGEEGAAEPYRYLMKNLRSRLMATQAWLEARLKGEELPKPEGLLTQ
NEELWEPLYACYQSLQACGMGIIANGDLLDTLRRVKCFGVPLVRIDIRQESTRHTEAL
GELTRYLGIGDYESWSEADKQAFLIRELNSKRPLLPRNWQPSAETREVLDTCQVIAEA
PQGSIAAYVISMAKTPSDVLAVHLLLKEAGIGFAMPVAPLFETLDDLNNANDVMTQLL
NIDWYRGLIQGKQMVMIGYSDSAKDAGVMAASWAQYQAQDALIKTCEKAGIELTLFHG
RGGSIGRGGAPAHAALLSQPPGSLKGGLRVTEQGEMIRFKYGLPEITVSSLSLYTGAI
LEANLLPPPEPKESWRRIMDELSVISCDVYRGYVRENKDFVPYFRSATPEQELGKLPL
GSRPAKRRPTGGVESLRAIPWIFAWTQNRLMLPAWLGAGTALQKVVEDGKQSELEAMC
RDWPFFSTRLGMLEMVFAKADLWLAEYYDQRLVDKALWPLGKELRNLQEEDIKVVLAI
ANDSHLMADLPWIAESIQLRNIYTDPLNVLQAELLHRSRQAEKEGQEPDPRVEQALMV
TIAGIAAGMRNTG

Мои вычисления с помощью Excel

Аминокислотный состав белка

Name	A	C	D	E	F	G	H	I	K	L	M	N	P	Q	R	S	T	V	W	Y
%	9,06	0,91	4,64	8,61	2,04	6,34	1,47	4,87	4,76	13,36	2,72	4,08	5,10	4,64	6,57	5,78	4,64	5,66	2,15	2,60

Длина последовательности – 883 аминокислотных остатка.
Молярная масса равна 99057,48 г/моль.
Средний электрический заряд белка CAPP_ECOLI при
- pH=1,0 равен +112,91 заряда электрона;
- pH=7,0 равен –15,55 заряда электрона;
- pH=8,0 равен –19,61 заряда электрона.
По данным "согласованного мнения трёх шкал гидрофобности" отношение количества гидрофобных к гидрофильным аминокислотных остатков в бактериальных транспортерах класса ТС.2А – 7,370, в протеоме E.coli – 1,100, в белке CAPP_ECOLI – 0,953.
Выводы и наблюдения по поводу вышеуказзанных отношений:соотношение гидрофобных и гидрофильных аминокислотных остатков в протеоме E.coli примерно одинаково(гидрофильных ненамного больше),в бактериальных транспортерах класса ТС.2А содержание гидрофобных аминокислотных остатков превышает содержание гидрофильных примерно в 7 раз, а в белке CAPP_ECOLI содержание гидрофобных аминокислотных остатков превышает содержание гидрофильных,однако разница несущественна.Соответственно, можно предположить, что данный белок CAPP_ECOLI не относится к бактериальным транспортерам класса TC.2A.

Данная диаграмма максимально наглядно иллюстрирует аминокислотный состав белка CAPP_ECOLI. (Получена с помощью возможностей Excel.)

Три самых редких аминокислотных остатка:

C Cys Cysteine Цистеин

W Trp Tryptophan Триптофан

H His Histidine Гистидин

Четыре наиболее часто встречающихся остатка

V Val Valine Валин

G Gly Glycine Глицин

A Ala Alanin Аланин

L Leu Leucine Лейцин

C	Cys	Cysteine	Цистеин
W	Trp	Tryptophan	Триптофан
H	His	Histidine	Гистидин

V	Val	Valine	Валин
G	Gly	Glycine	Глицин
A	Ala	Alanin	Аланин
L	Leu	Leucine	Лейцин