Практикум 12. Задание к лекции по метаболическим путям

Метаболический путь: map00261

  1.  
    tree_of_terms
    Рисунок 1.
    Изображение референсного пути map00261
  2.  
    tree_of_terms
    Рисунок 2.
    Изображение референсного пути map00261 с выбранной реакцией R10147 (с 4.3.3.7 - K01714).
  3.  
    tree_of_terms
    Рисунок 3.
    Изображение реакции R10147, осуществляемой K01714

    Реакция: L-Aspartate 4-semialdehyde + Pyruvate <=> (2S,4S)-4-Hydroxy-2,3,4,5-tetrahydrodipicolinate + H2O

    Вовлечена в биосинтез лизина и некоторых вторичных метаболитов.

  4. K01714 (Entry), dapA (Name); 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase (Definition) 


  5. 4. Lyases - т. е. фермент катализирует реакции негидролитического и неокислительного разрыва (и образования) химических связей
4.3  Carbon-nitrogen lyases - т. е. фермент разрывает (или образовывает) C—N связи
4.3.3  Amine-lyases - т. е. фермент разрывает связь с образованием амина (или синтезирует связь с использованием аминов в качестве субстрата). То есть одним из реагентов или продуктов является амин.
4.3.3.7  4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase - собственно фермент
K01714  dapA; 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase
  6.  
    kitasatospora
    Рисунок 4.
    Изображение референсного пути map00261, Kitasatospora setae (моя бактерия с 1 семестра)
     
    arabidopsis
    Рисунок 5.
    Изображение референсного пути map00261, Arabidopsis thaliana (моя бактерия с 1 семестра)

  7. Для Kitasatospora setae описано 7673 генов и 130 метаболических путей.

Вернуться на страницу семестра