Создание выборки белков с одинаковыми функциями

Задача – создать выборку белков, имеющих то же описание функции, что и фумарат гидратаза класс II.

Часть 1. Краткое описание прототипа по данным банка аминокислотных последовательностей Swiss-Prot, release: создан 13 августа 1987, дата последнего обновления 15 марта 2004.

Часть 2. Описание процедуры составления выборки

При помощи поисковой системы SRS в банке данных SwissProt был произведён поиск белков следующим способом:
- В поле Description вводилось описание функций белка (Fumarate hydratase class II);
- в поле Species(Taxonomy) - названия организмов(таксонов), в которых проводился поиск.

Часть 3. Описание выборки

Для выборки отбирались белки, описание функций которых строго соответствует описанию функций моего белка.
Из каждого таксона, по которому вёлся поиск, было взято по 3 белка.

Произведённые запросы:

Результаты поиска в видах Escherichia coli, Salmonella typhi и Yersinia pestis:

Результаты поиска по грамм-положительным бактериям(Firmicutes):

Результаты поиска по всем остальным бактериям:

Результаты поиска археям(Archae):

Поиск по эукариотам(Eukaryota) резулитатов не дал.