Карта Рамачандрана

Работа с программами MS Excel и RasMol

Карта Рамачандрана - метод изображения аминокислотных остатков данного белка, при котором они распределяются в двухмерном пространстве в зависимости от углов фи и пси, образуемых при построении белка. На карте Рамачандрана отмечены сгущения, отмеченные жёлтым и зелёным овалами. У областей сгущения были примерно определены центры и радиусы. С помощью логических функций Excel найдены участки полипептидной цепи, подходящие в полученные диапазоны.
Область, отмеченная синей штриховкой, - место размещения аминокислотных остатков с φ>0.


  1. "Жёлтая" область имеет границы примерно φ=-70°±40°, ψ=-30°±40°. Соответствует области правоспирализованных спиралей (α-спиралей).
  2. "Зелёная" область имеет границы примерно φ=-100°±70°, ψ=135°±40°. Соответствует области β-тяжей.
  3. Область с φ>0 имеет интересную особенность - в SdhB из входящих в неё 66 аминокислотных остатков 40 являются остаками глицина. Это связано с тем, что он не имеет бокового радикала, и имеет большую свободу в установке угла φ.