PROSITE - база данных, в которой содержатся биологически значимые сайты, паттерны и, отчасти, профили.
На основе множественного выравнивания выбираются несколько функционально важных остатков, по ним создается паттерн.

Pfam - база данный, созданная как коллекция доменов.
Домен - компактная, относительно независимо сворачивающаяся структура, относительно консервативная в процессе эволюции.
На основе множественного выравнивания строят профиль-НММ.

InterPro - интегрированная база данных, включает в себя содержимое всех известных "приличных" баз данных.

Исследования доменной струтуры моего белка

• Мотивы в аминокислотной последовательности
• Доменной структура
• Данные InterPro

  На главную страницу