В базе данных PROSITE собрана коллекция сайтов, мотивов и доменов. Они описаны с помощью паттернов.
С помощью программы ScanProsite (Scan a protein for PROSITE matches) были найдено 7 известных мотивов в последовательности TYASY_ECOLI:
* - отмечены часто встречающиеся в белках мотивы
Пример расшифровки паттерна:
Петтерн: R-x(2)-[LIVM]-x(3)-[FW]-[QN]-x(8,9)-[LV]-x-P-C-[HAVM]-x(3)-[QMT]-[FYW]- x-[LV].
Моя расшифровка: RarLtwvFQnsitpadsyLpPCAsarMFlL
| | || |
Расшифровка PROSITE:RriIvsaWNvgeldkma.LaPCHaffQFyV
Обе расшифровки верны, хотя видно, что они совсем не похожи.