К сожалению, изображение недоступно

Базы последовательностей белков

Исследуемый белок: beta-lactamase domain-containing protein (белок, содержащий домен бета-лактамазы) бактерии Cyanothece sp. PCC 8801.

Таблица 1. Идентификаторы в разных базах данных
База данных Идентификатор
Uniprot B7JW79_CYAP8; AC - B7JW79
Uniref50 UniRef50_P54123
RefSeq Proteins YP_002373080.1

История изменений записи Uniprot для белка beta-lactamase domain-containing protein

Первая версия (1) белка в Uniprot была создана 10 февраля 2009 г., а последняя (37) — 11 марта 2015г. Описание белка было существенно изменено. Например, поменяли идентификатор белка, добавили ссылки на 30 других баз данных, было изменено видовое название организма (источника данного белка) и его таксономия.

Рис.1 Пример изменения видового названия организма и его таксономии

К сожалению, изображение недоступно

Рис.2 Пример ссылок на другие базы данных

К сожалению, изображение недоступно


Сравние записи Uniprot белка с записями четырех гомологичных белков.


Гомологичные белки отличаются штаммами организмов (источников данного белка).

В записи Uniprot представлены различные особенностиб участков последовательностей, в том числе характеристика дисульфидных связей.
Варианты:
I. Внутрицепочечные дисульфидные связи

Рис.3 Внутрицепочечные дисульфидные связи

К сожалению, изображение недоступно
II. Межцепочечные дисульфидные связи

      1. Связи между гомодимерами
            а) Параллельная гомодимерная связь

Рис.4 Параллельная гомодимерная связь

К сожалению, изображение недоступно
            b) Антипараллельная гомодимерная связь

Рис.5 Антипараллельная гомодимерная связь

К сожалению, изображение недоступно
      2. Связи между двумя цепями или белками, образованные из одного белка в ходе протолиза

Рис.6 Межцепочные связи

К сожалению, изображение недоступно
      3. Связи между гетеродимерами
            a) Альфа-цепь

Рис.7 Альфа-цепь

К сожалению, изображение недоступно
            b) Бета-цепи

Рис.8 Бета-цепи

К сожалению, изображение недоступно
III. Редокс-активные центры

Рис.9 Редокс-активные центры

К сожалению, изображение недоступно


© Князева Анастасия, 2015