Учебный Сайт Николая Николаева

Назад на страницу семестра

Филогенетические деревья.

Таблица 1.Отобранные бактерии.

Название	Мнемоника
Mycolicibacterium vanbaalenii	MYCVP
Mycobacterium leprae	MYCLE
Mycobacterium tuberculosis	MYCTU
Rhodococcus jostii	RHOJR
Corynebacterium efficiens	COREF
Corynebacterium diphtheriae	CORDI
Rubrobacter xylanophilus	RUBXD

(RUBXD, (CORDI, COREF), (RHOJR, (MYCVP, (MYCLE, MYCTU))))

Рис. 1. Изображение дерева.

Дерево содержит четыре нетривиальные ветви:

{RUBXD, COREF, CORDI} против {RHOJR, MYCVP, MYCTU, MYCLE};
{RUBXD, COREF, CORDI, RHOJR} против {MYCVP, MYCTU, MYCLE} (выделяет семейство Mycobacteriaceae);
{RUBXD, COREF, CORDI, RHOJR, MYCVP} против {MYCTU, MYCLE} (выделяет род Mycobacterium);
{COREF, CORDI} против {RUBXD, RHOJR, MYCVP, MYCTU, MYCLE} (выделяет род Corynebacterium).

В табл. 2 представлена полная таксономия выбранных бактерий:

Таблица 2.Таксономия бактерий.

Бактерия	(без ранга)	Надцарство	Клада	Филум	Класс	Порядок	Семейство	Род
MYCVP	Клеточные организмы	Bacteria	Terrabacteria group	Actinobacteria	Actinomycetia	Corynebacteriales	Mycobacteriaceae	Mycolicibacterium
MYCLE	Клеточные организмы	Bacteria	Terrabacteria group	Actinobacteria	Actinomycetia	Corynebacteriales	Mycobacteriaceae	Mycobacterium
MYCTU	Клеточные организмы	Bacteria	Terrabacteria group	Actinobacteria	Actinomycetia	Corynebacteriales	Mycobacteriaceae	Mycobacterium
RHOJR	Клеточные организмы	Bacteria	Terrabacteria group	Actinobacteria	Actinomycetia	Corynebacteriales	Corynebacteriales	Rhodococcus
COREF	Клеточные организмы	Bacteria	Terrabacteria group	Actinobacteria	Actinomycetia	Corynebacteriales	Corynebacteriales	Corynebacterium
CORDI	Клеточные организмы	Bacteria	Terrabacteria group	Actinobacteria	Actinomycetia	Corynebacteriales	Corynebacteriales	Corynebacterium
RUBXD	Клеточные организмы	Bacteria	Terrabacteria group	Actinobacteria	Rubrobacteria	Rubrobacterales	Rubrobacteraceae	Rubrobacter

Интересно, что имеющееся дерево не поддерживает существования семейства Corynebacteriales.