База данных GO

GO Enrichment Analysis

1)Для анализа был взят list31_nsv2002.txt, в котором содержится 22 ID

2)После проверки на обогащение для анализы были использованы все 22 ID

3)В выдаче оказалось 69 GO terms. Это все terms c поправленным P-value меньше, чем 0.05

4)10 самыми значимыми являются:

aminoglycan biosynthetic process (GO:0006023) 2.15E-42

keratan sulfate biosynthetic process (GO:0018146) 3.02E-42

keratan sulfate metabolic process (GO:0042339) 1.88E-41

glycosaminoglycan biosynthetic process (GO:0006024) 3.83E-40

mucopolysaccharide metabolic process (GO:1903510) 8.68E-40

aminoglycan metabolic process (GO:0006022) 1.61E-39

glycosaminoglycan metabolic process (GO:0030203) 3.90E-37

sulfur compound biosynthetic process (GO:0044272) 9.93E-36

sulfur compound metabolic process (GO:0006790) 5.57E-30

carbohydrate derivative biosynthetic process (GO:1901137) 2.92E-28

5)Далее был построен граф с пятью наиболее значимыми GO terms: GO:0006023, GO:0018146, GO:0042339,GO:0006024, GO:1903510

6) Все узлы графа связаны типом отношений is a. Видно, что все анализируемые GO terms являются процессами метаболизма макромолекул.

7)Можно предположить, что ID из даного списка связаны с метаболизмом макромелекул