Филогенетическое дерево


1.Отобранные бактерии:

Название Мнемоника
Arthrobacter sp.ARTS2
Clavibacter michiganensisCLAMS
Leifsonia xyliLEIXX
Mycobacterium lepraeMYCLE
Mycobacterium tuberculosisMYCTU
Streptomyces avermitilisSTRAW
Thermobifida fuscaTHEFY

2.Скобочная формула дерева: (((STRAW, THEFY), (ARTS2,(LEIXX, CLAMS))), (MYCLE, MYCTU));


3.Изображение дерева:

Рис.1 . Филогенетическое дерево.

4.Ветви дерева:

Дерево содержит следующие нетривиальные ветви:

{STRAW, THEFY} против {ARTS2, LEIXX, CLAMS, MYCLE, MYCTU}

{LEIXX, CLAMS} против {STRAW, THEFY, ARTS2, MYCLE, MYCTU}

{LEIXX, CLAMS, ARTS2} против {STRAW, THEFY, MYCLE, MYCTU}

{STRAW, THEFY, ARTS2, LEIXX, CLAMS} против {MYCLE, MYCTU}


5.Учёт таксономии:

Arthrobacter sp. Bacteria; Terrabacteria group; Actinobacteria; Actinomycetia; Micrococcales; Micrococcaceae; Arthrobacter; unclassified Arthrobacter
Clavibacter michiganensisBacteria; Terrabacteria group; Actinobacteria; Actinomycetia; Micrococcales; Microbacteriaceae; Clavibacter
Leifsonia xyli Bacteria; Terrabacteria group; Actinobacteria; Actinomycetia; Micrococcales; Microbacteriaceae; Leifsonia
Mycobacterium leprae Bacteria; Terrabacteria group; Actinobacteria; Actinomycetia; Corynebacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium
Mycobacterium tuberculosis Bacteria; Terrabacteria group; Actinobacteria; Actinomycetia; Corynebacteriales; Mycobacteriaceae; Mycobacterium; Mycobacterium tuberculosis complex
Streptomyces avermitilisBacteria; Terrabacteria group; Actinobacteria; Actinomycetia; Streptomycetales; Streptomycetaceae; Streptomyces
Thermobifida fusca Bacteria; Terrabacteria group; Actinobacteria; Actinomycetia; Streptosporangiales; Nocardiopsaceae; Thermobifida

Все выбранные организме принадлежат к кладе Terrabacteria, "классу" Actinomycetia. Видно, что ветвь {STRAW, THEFY} выделяет порядок Corynebacteriales, ветвь {MYCLE, MYCTU} - род Mycobacterium, ветвь {LEIXX, CLAMS, ARTS2} выделяет порядок Micrococcales, ветвь {LEIXX, CLAMS} выделяет семейство Microbacteriaceae